FastSelect rRNA Kit (Human)
锁核酸法rRNA快速去除，助力宏转录病原检测
- 去除人总RNA中的rRNA
- mRNA和非编码RNA分析
- 宏转录组检测
- 快速：一步去除，流程仅需2min
- 兼容：兼容1 ng - 1 µg total RNA，兼容病原样本、FFPE样本
- 高质：高效的rRNA去除，优异的病原检出，严格的背景菌质控
FastSelect rRNA Kit (Human)适用于去除人总RNA中的rRNA(包括细胞质28S、18S、5.8S、5S rRNA，以及线粒体16S、12S rRNA)，保留mRNA及其它非编码RNA；该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本(例如FFPE样本)，得到的RNA可用于mRNA和非编码RNA(例如IncRNA)分析。该试剂盒能够快速去除人总RNA中的rRNA，操作简便快速，应用于病原微生物检出领域，能够显著提高病原检出。
1. 兼容不同起始量
以293T total RNA为起始模板，投入量分别为1 ng、10 ng、100 ng、1 μg。使用Vazyme #N460以及友商同类产品对rRNA去除后进行建库。通过对高质量的Clean Reads进行分析，结果显示在不同投入量下，Vazyme #N460的rRNA残留率均少于Supplier A，且基因检出数优于Supplier A。说明Vazyme #N460的rRNA去除能力更高，基因检出数更加丰富。
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图1. 不同起始量下rRNA残留情况 |
图2. 不同起始量下基因检测数 |
2. 兼容病原样本
将293T、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、PEDV按500 : 1 : 1 : 10比例模拟临床病原样本，分别以1ng、100ng的模拟样本的total RNA为起始模板，分别使用Vazyme #N460以及Supplier A同类产品进行rRNA去除后，参照Vazyme #UNR605以及Supplier A同类产品进行建库。通过对病原检出进行分析，结果显示Vazyme #N460在1ng和100ng总RNA投入量下进行模拟样本病原检测，掺入的病原均有检出，且三种病原的RPM值均优于Supplier A，显著优于未去除组的病原检出。
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图1. 病原样本-1 ng投入量下的病原RPM值 |
图2. 病原样本-100 ng投入量下的病原RPM值 |
3.兼容FFPE样本
以100ng的FFPE样本的total RNA为起始模板，分别使用Vazyme #N460以及Supplier A同类产品进行rRNA去除后，参照Vazyme #UNR605以及Supplier A同类产品进行建库。通过对高质量的Clean Reads进行分析，结果显示针对FFPE样本，Vazyme #N460的rRNA残留率均少于Supplier A，且基因检出数优于Supplier A。说明Vazyme #N460对于FFPE样本的的rRNA去除能力更高，基因检出数更加丰富。
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图1. FFPE样本的rRNA残留率 |
图2. FFPE样本的基因检出数 |
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组分 |
N460-01 |
N460-02 |
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Fast rRNA Removal Mix |
24 μl |
96 μl |
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Nuclease-free ddH2O |
1 ml |
4×1 ml |
-30 ~ -15℃保存，≤0℃运输。
Q1：RNA样本起始量如何选择？
A1：用于RNA-Seq的样本，总RNA起始量由所使用的RNA建库试剂盒的范围决定。
Q2：如果文库浓度过低，可以从哪些角度去寻找原因及如何改进？
A2：1. 如果文库的产量低于其他去除方法，这通常是由该去除方法对rRNA去除效果增加引起的，这是正常的。根据测试数据，增加1 - 2个文库扩增循环数通常足以达到上机测
序要求。
2. 以高质量的RNA样本为模板构建得到的文库浓度均能达到上机测序要求，如果无法提供合格的RNA样本，可以尝试使用以下方法弥补：
①提高样本起始量，上限1 μg；
②可增加几个重复样本，纯化后合并进行扩增；
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