VAHTS DNA Clean Beads
AMPure XP Beads的理想替代品
DNA纯化与分选
· 高性价比
· 货期短
· 和AMPure XP Beads具有完全相同的使用方式,无需重新摸索条件
· 回收率、文库大小和AMPure XP Beads一致
· 适合于DNA,RNA建库,与各品牌建库试剂均有较好的兼容性
· 严格的批次质控更好的价格,更短的货期
1.通过两步磁珠纯化达到准确的分选效果
用TruePrep DNA Library Prep Kit V2 for Illumina(Vazyme #TD501)构建DNA文库。文库初始大小为200-1500 bp,用VAHTS DNA Clean Beads按下表的条件对PCR产物进行分选,得到不同大小的文库,用Agilent 2100 Bioanalyzer进行分析。
2.DNA文库构建,与AMPure XP Beads比较
以50ng human DNA为起始模板,用TruePrep DNA Library Prep Kit V2 for Illumina(Vazyme #TD501)构建文库。分别用VAHTS DNA Clean Beads和AMPure XP Beads按相同条件分选平均长度约为470,570,670的文库(对应的insert size为350,450,550bp),用Agilent2100 Bioanalyzer进行分析。
3.RNA文库构建,与AMPure XP Beads比较
以1μg或100ng Universal Human Reference RNA(UHRR)为起始模板,用TruSeq RNA Sample Prep Kit V2(Illumina #RS-122-2001)构建RNA文库,分别用VAHTS DNA Clean Beads和AMPure XP Beads按相同条件操作,获得平均长度约为280bp的文库(对应的insert size约为160 bp),用Agilent Bioanalyzer进行分析。
VAHTS DNA Clean Beads基于SPRI (Solid Phase Reverse Immobilization)原理,适合于高通量测序文库构建中DNA纯化与片段大小分选。VAHTS DNA Clean Beads兼容各品牌的DNA,RNA建库试剂盒和文献报道的建库流程,和目前广泛使用的AMPure XP Beads使用方式完全相同,文库的产量、大小分布与AMPure XP Beads高度一致,因此可以无缝替代AMPure XP Beads,有效降低您的建库成本。
组分 |
N411-01 |
N411-02 |
N411-03 |
VAHTS DNA Clean Beads |
5 ml |
60 ml |
450 ml |
2-8℃保存。
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Q1:不小心将磁珠放到-20℃,但未结冰,是否可以继续使用?
A1:不建议使用。因为低温会破坏磁珠的结构,使得磁珠的抓取效率降低,需要重新购买磁珠。
Q2:磁珠分选的原理是什么?
A2:第一轮磁珠结合分子量较大的DNA,通过丢弃磁珠去除这部分产物;第二轮磁珠结合剩余产物中分子量较大的DNA,通过丢弃上清去除分子量较小的DNA。
初始样品中的很多组分都会干扰双轮磁珠分选效果。因此,当分选方案执行位置不同时,双轮磁珠使用量也不尽相同。
Q3:是否可以纯化单链DNA的磁珠,如果可以,该使用多少磁珠?
A3:磁珠可以纯化双链DNA和单链DNA,磁珠纯化的倍数可以参考双链的说明书。
Q4:N411是否可以用于提取DNA?
A4:使用N411可以实现直接将样本裂解后用磁珠将其中的gDNA提取出来,可能效率没有专用试剂盒的高,因为我们这款磁珠的定位是在纯化和分选。
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