Nuclear and Cytoplasmic Extraction Kit
核质蛋白提取试剂盒
核质一刀两断,蛋白产量无忧
在新鲜或冻存的动物细胞/组织样本中,依次获得细胞质蛋白和细胞核蛋白
不同蛋白在细胞内发挥功能的场所不同,即亚细胞定位不同,其中核蛋白和胞质蛋白相关研究较多。细胞核蛋白主要参与基因复制、转录调控等生命过程,细胞质蛋白主要涉及物质转运、物质代谢、信号传递等功能。Nuclear and Cytoplasmic Extraction Kit能够从哺乳动物的细胞或组织中逐步分离、制备高纯度的核蛋白和胞质蛋白,整个过程约90 min。提取得到的蛋白可用于Western Blot,EMSA,Footprinting,报告基因检测及酶活力测定等后续操作。
核质蛋白分离效果好,纯度优
新鲜/冻存样本均适用,产量高
1)核质蛋白分离效果好,纯度优
使用Vazyme #E101与同类产品Supplier A,按照各自说明书对细胞/组织样本进行核质蛋白提取,蛋白定量后进行SDS-PAGE凝胶电泳(每孔上样量为10 μg)。结果表明,Vazyme #E101可兼容不同蛋白的提取,同时,获得的核蛋白和胞质蛋白具有更小的交叉污染。
2)新鲜/冻存样本均适用,产量高
Vazyme #E101可以兼容多种新鲜/冻存的细胞/组织样本,且以Supplier A为参考,对提取的核蛋白、胞质蛋白进行同等体积上样,E101提取的核蛋白,其目的条带表达信号更强。
2 ~ 8℃保存,冰袋运输。
Q1:使用E101提取,细胞质和细胞核组分之间会是零交叉污染吗?
A1:使用E101进行提取时,由于样本自身原因(如细胞膜结构)、操作过程等影响,核质组分之间可能存在微弱交叉污染,当细胞质和细胞核之间的交叉污染率在10%左右,其纯度满足大多数涉及细胞核提取物的实验。
Q2:胞质蛋白内有核蛋白污染
A2:(1)加入Cytoplasm Extraction Buffer B后孵育时间过长,部分核膜被裂解,可适当减少孵育时间;
(2)加入Cytoplasm Extraction Buffer B后涡旋剧烈,部分核膜被裂解,可降低涡旋力度,涡旋时间不宜过长。
Q3:核蛋白内有胞质蛋白污染
A3:(1)细胞量过多导致裂解不充分,细胞量与裂解buffer体积要匹配;
(2)细胞团中细胞质膜未被完全破碎,在加入Cytoplasm Extraction Buffer B后延长孵育时间。
Q4:“加入Cytoplasm Extraction Buffer B后孵育4min”,该时长条件兼容所有细胞或者组织吗
A4:不能兼容,不同种类的细胞或组织,其细胞膜结构也不一样,加入Cytoplasm Extraction Buffer B后,细胞质膜/核膜的破裂时间不一样;可以先进行预实验,按照2min、4min、8min的时间梯度进行孵育,通过Western Blot实验检测交叉污染情况。
Q5:提取物内仅含有蛋白吗,是否有其他物质
A5:核质分离的产物是多样的,并非仅限于蛋白,细胞质组分主要包含mRNA、细胞质蛋白、细胞器等;细胞核组分包括核蛋白、核RNA、少量DNA、核仁等。
Q6:E101是否可用于核质分离后的核酸提取
A6:可以,需要注意的是,用于RNA提取时,本试剂非RNase Free,需要另外加RNase抑制剂,且整个提取过程需要在无RNase条件下进行。
Q7:细胞核提取物是否可以用于做CUT-Tag、ATAC-seq等测序分析吗
A7:不可以,CUT-Tag、ATAC-seq等测序分析对细胞核的完整性有严格的要求,E101不能满足。
Q8:E101分离的核质产物在进行蛋白定量时,是否可以用BCA定量法
A8:不可以,E101相关组分可与Cu2+反应,影响检测结果,可使用Detergent Compatible Bradford Protein Quantification Kit (Vazyme #E211)测定蛋白浓度。
Q9:使用E101提取试剂提取核蛋白后,基因组 DNA 位于何处
A9:主要存在于最后离心的沉淀中。
Q10:试剂盒在室温下或-20℃存放了两三天有影响吗
A10:没有影响,但是不能长时间室温放置,也建议不要进行反复多次冻融。
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