Magnetic Blood DNA Extraction Kit(Prepackaged)
磁珠法血液基因组DNA提取试剂盒(预封装)
便捷、高量、高纯-躺赢就找它!
酶切;PCR;荧光定量PCR;文库构建;Southern杂交等
本试剂盒适用于从血液样本中分离纯化高质量基因组DNA。本试剂盒匹配的全自动核酸提取仪(Vazyme #VNP-32P)利用磁珠吸附原理,通过特制的磁棒吸附、转移和释放磁珠,实现磁珠/核酸的转移,自动、快速完成核酸的提取和纯化。其分离的gDNA适用于多种下游应用,包括PCR、Real-Time PCR、文库构建、芯片分析等。
- 破译多种血液样本:兼容新鲜或冻存无核抗凝外周血、骨髓血、脐带血、浓缩血、白膜层和血卡等
- 全自动、快速便捷:搭配VNP-32P,无需暂停,48 min完成32个样本的提取
- 量高质优且单一:提取的gDNA产量高、纯度优、完整性好
1.高质高纯
使用Vazyme #DM102与市场上同类产品Supplier A-B同时提取200 μl EDTA、枸橼酸钠和肝素钠冻存全血、EDTA反复冻融血和浓缩血(去除血浆)的gDNA,Qubit测定浓度,OneDrop测定纯度,1.2%琼脂糖凝胶电泳检测完整度。结果表明:DM102在不同血液样本上提取产量均高于Supplier A-B(图1);纯度优于Supplier A,与Supplier B相当(图2);提取产物无RNA残留和明显蛋白污染(图3)。
图1. 不同抗凝血液样本gDNA产量比对结果
图2. 不同抗凝血液样本gDNA纯度比对结果
图3. 不同抗凝血液样本gDNA产物凝胶电泳图
2.投入体积灵活
使用Vazyme #DM102与市场上同类产品Supplier A-B同时提取体积为50、100、250、300 μl的EDTA冻存全血,Qubit测定浓度。结果表明:DM102能够兼容50-200 μl抗凝全血样本,除250 μl和300 μl投入体积下产量与Supplier B相当,其它投入体积下产量均高于Supplier A-B(图4)。
图4. EDTA冻存全血不同投入体积下gDNA产量比对结果
3.兼容特殊血样
使用Vazyme #DM102与市场上同类产品Supplier A-B同时提取猪血、白膜层和血卡,Qubit测定浓度。结果表明:DM102的提取产量均高于Supplier A和Supplier B(图5)。
图5. 特殊血液样本gDNA产量比对结果
4.下游测序无抑制
使用Vazyme #DM102提取EDTA冻存全血gDNA,分别投入1 ng和100 ng进行建库(Vazyme #ND617),分析二代测序下机数据。结果表明:DM102提取产物不影响下游建库及测序质量(图6)。
GC (%): GC碱基占总碱基的比例,人类基因组GC比例约在42%左右
Q30 (%):测序正确率为99.9%的碱基占总碱基的比例
Median lnsert size (bp):测序片段实际大小(插入片段)的中位数
Duplicate rate:比对到参考基因组上相同起始、结束位置的完全重复的reads占总测序reads的比例
Uniformity:满足80%的目标碱基达到平均覆盖深度所需要的额外测序的倍数,表征片段捕获区域测序覆盖的均一性
图6. gDNA不同投入量下二代测序质量分析
组分 |
DM102-01 (2 × 16 T) |
DM102-02 (6 × 16 T) |
DNA Reagents (Prepackaged for DM102) |
2 × 16 T |
6 × 16 T |
Proteinase K |
2 × 750 µl |
5 × 1 ml |
Proteinase K,2 ~ 8℃保存,根据不同目的地调整运输方式;
其他组分,15 ~ 25℃保存,室温运输。
Q1:程序问题-程序不能导入仪器。
A1:官网下载程序,解压为“Program”的文件夹后整个拖入U盘(U盘要求:文件系统FAT32),插入仪器即可导入程序。
Q2:DM102可以搭配其它自动化提取仪器使用吗?
A2:理论上可以,但由于不同仪器间参数不同,需要进行针对性地调试。
Q3:DM102可以投入超过200 μl的血液样本吗?
A3:可以,测试过高达300 μl的投入量,建议投入200 μl。
Q4:DM102未加样本运行过一次的试剂,可以再加血液样本进行提取吗?
A4:不建议再次提取,会影响产物质量。
Q5:DM102除了提取血液样本,还测试过其它样本吗?
A5:测试过血卡、细胞和拭子液等。但血卡样本需要额外搭配一款试剂(Buffer ACL)进行前处理。
Q6:白膜层样本提取方案?
A6:白膜层是由全血浓缩的白细胞悬液组成,带有一小部分血浆和浓缩的红细胞。核酸含量丰富,建议裂红处理、离心、重悬细胞沉淀后进行提取。
Q7:提取gDNA的同时可以提取到cfDNA吗?
A7:可以提,但由于cfDNA本身含量较少,且红细胞裂解后释放的核酸酶会降解cfDNA。建议使用专门的试剂盒进行提取。
Q8:DM102能否提取禽类有核血液?
A8:可以的。但有核血液含有丰富的核酸,建议减少投入量至5-10 µl,PBS补足至200 µl。
Q9:DM102测试过手提的效果吗?
A9:建议使用专门的试剂盒-DM101进行手提。
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