VAHTS Universal DNA Library Prep Kit for Illumina V3
全基因组测序;全外显子或其他靶向捕获测序;扩增子测序;免疫共沉淀测序;宏基因组测序;甲基化测序
· 更短建库耗时,单个文库构建仅需75 min
· 更高接头连接效率,更高文库转化率
· 更简便快捷操作,预混Mix减少操作误差
· 更宽模板兼容范围,起始Input DNA可兼容100 pg-4 μg
· 更广泛样本兼容性,适用于片段化DNA、cfDNA、FFPE DNA、ChIP DNA等
K*和N*表示K公司和N公司同质产品,下同。
图1 以HEK239 T细胞片段化DNA建库,input DNA分别为100 pg,1 ng,100 ng和1 μg,根据相应说明书操作进行文库构建,比较扩增文库产出;由结果可知,对于不同起始量DNA,VAHTS Universal DNA Library Prep Kit for Illumina V3建库试剂盒在同等扩增循环数条件下,文库产出大大高于其他同质产品。
图2 分别以1 ng cfDNA、10 ng FFPE DNA和1 μg gDNA建库,根据各产品相应说明书操作进行文库构建,比较扩增文库产出;由结果可知,对于不同来源的文库,VAHTS Universal DNA Library Prep Kit for Illumina V3建库试剂盒在同等扩增循环数条件下,产出大大高于其他同质产品。
VAHTS Universal DNA Library Prep Kit for Illumina V3是针对Illumina高通量测序平台定向优化而成的文库构建试剂盒。本试剂盒可以将100 pg - 4 μg Input DNA转换成Illumina高通量测序平台专用文库。作为新的升级版本,VAHTS Universal DNA Library Prep Kit for Illumina V3通过对末端修复模块、连接模块和文库扩增模块的整体改进,使文库转化率和扩增文库产出大幅提升,广泛适用于多种样本的PCR或PCR-Free文库构建,且兼容靶向捕获流程。试剂盒中提供的所有试剂都经过了严格的质量控制和功能验证,较大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。
本产品兼容多种样本类型:基因组DNA (Genomic DNA)、游离DNA (cfDNA、ctDNA)、石蜡切片DNA (FFPE DNA)、免疫共沉淀DNA (ChIP DNA)、多重扩增子(Amplicons)等。
-30 ~ -15℃保存。可于-20 ~ 0℃运输。
Q1:文库产量偏低
A1: (1)重新定量投入模板量,确认模板起始量是否正确。若低于下限(1 ng),需提高投入模板量;
(2)若模板质量较差,可依据说明书适当提高循环数或使用高质量模板;
(3)请确认每一步体系以及程序是否按照说明书进行,并注意每一步骤中各项操作细节;
(4)文库纯化磁珠干燥环节,不能时间过长导致磁珠过于干燥。过于干燥也会降低产量;
(5)进行文库扩增时,需确保无磁珠残留,否则可能抑制扩增反应;
(6)qPCR文库定量时,请确保循环时间以及循环数正确。
Q2: 建库后,嵌合体占比较高。
A2: 这种情况是出现过度扩增。过度扩增的文库是在引物已经耗尽的情况下,文库跟文库直接乱搭造成的非特异性扩增,而引入人为造成的嵌合体。
Q3:不同的样品之间加了一样的index,怎么解决?
A3: 将同样index的样品分开不同的lane上机。
Q4:2100检测有明显的接头二聚体特征峰
A4:(1)可适当降低磁珠纯化的乘数;
(2)适当降低接头浓度。
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