FastPure Microbiome DNA Isolation Kit
高产快速,病原微生物DNA提取
微生物DNA提取;产物可用于PCR;qPCR;宏基因组文库构建;芯片分析;二代测序
- 高产:DNA提取产量高、完整度好,满足下游应用要求
- 超快:整个提取流程仅需 23 min
- 灵活:兼容血液、拭子、痰液、肺泡灌洗液等多种临床样本
本试剂盒试剂盒采用化学法与机械法相结合的裂解方法,能够高效裂解细胞壁较厚的细菌或真菌类样本,实现宿主及微生物基因组DNA的快速分离纯化。适用于血液、其他生物液体(肺泡灌洗液、痰液、脑脊液等)、拭子类、细菌、真菌培养物及动物组织样本。提取过程安全无毒、操作便捷,且无需使用酚氯仿等有毒试剂、无需进行耗时的醇类沉淀及RNase处理,在保障核酸提取效率的同时较大限度地去除RNA、蛋白、脂类及其他杂质。分离的DNA适用于PCR、Real-Time PCR、宏基因组文库构建、芯片分析等多种下游应用。
1. DNA提取产量高、完整度好
以生物液体样本(血液、肺泡灌洗液、口腔拭子、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、毕赤酵母)和组织样本(小鼠的心、肝、脾、肺、肾、脑、肌肉、脂肪)为测试样本,参照Vazyme #DC501、Vazyme #DC112、Q*、Z*和M*公司同类产品的实验流程进行宿主及微生物总DNA提取。使用Qubit检测提取产物浓度,并使用琼脂糖凝胶电泳检测DNA完整度以及RNA残留情况。结果表明:Vazyme #DC502 的提取产量高,且提取产物的完整度和 RNA 残留情况优于同类产品。
图1. 不同样本类型下DNA提取得率
2. 不同种类微生物DNA提取效率高
以Z*公司微生物标准品(3 种革兰氏阴性菌、5 种革兰氏阳性菌、2 种酵母)为测试样本,参照Vazyme #DC502、Q*和M*公司同类产品的实验流程进行微生物DNA提取;使用Vazyme #ND617进行文库构建,经质控合格后的文库使用Illumina HiSeq X10平台进行PE150测序分析。结果表明:Vazyme #DC502对不同种类微生物(革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌、真菌)DNA提取效率和Q*公司同类产品相当,优于M*公司同类产品。
图2. 提取产物中10种菌的相对丰度
备注:Theoretical 为理论上10种菌的相对丰度
Box1,15 ~ 25℃保存,室温运输;
Box2,-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输;
Box3,2 ~ 8℃保存,根据不同目的地调整运输方式
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