Hyperactive Universal CUT&Tag Assay Kit for Illumina Pro
小投入，大收获——兼容低细胞起始量和qPCR的CUT&Tag试剂盒
蛋白质-DNA互作
样本起始量更低：技术升级，兼容更低的细胞投入量
pA/G-Tnp升级：精准靶向，切割效率高，背景低
提取模块升级：提取磁珠新升级，有效回收小片段
添加DNA Spike-in：数据标准化，减少实验误差，矫正组间差异
Hyperactive Universal CUT&Tag Assay Kit for Illumina Pro是针对Illumina高通量测序平台定向开发的用于研究蛋白质-DNA相互作用的试剂盒。CUT&Tag (Cleavage Under Target & Tagmentation)技术使用Protein A/G融合的转座酶，在抗体引导下精准靶向目的蛋白，并在目的位点附近进行DNA的片段化。本试剂盒优化了实验反应体系和建库流程，与传统的ChIP-Seq相比，具有细胞投入量低、实验周期短、信噪比高、可重复性好等优势，尤其适用于早期胚胎发育、干细胞、肿瘤以及表观遗传学等研究领域。
本产品中所涉及的方法已经获得中国发明专利，专利号为ZL 2023 1 0474512.0。
1. 兼容低细胞投入
针对低起始量的293细胞（10、25、50、100 cells），使用TD904进行H3K4me3抗体的CUT&Tag实验，通过Agilent 2100 Bioanalyzer进行文库分布检测。结果显示，对于低细胞投入量（10、25、50、100 cells），TD904均可构建出相似的ladder状的文库，说明TD904能够兼容低细胞起始量的实验；同时，由于pA/G-Tnp 的升级，靶向切割更加精准，重复性更好；升级后的提取磁珠能够有效的回收小片段，峰型更完整。
图1. 投入10、25、50、100 cells后的文库片段分布
在低细胞投入下，如10个细胞，TD904仍能获得明显的TSS富集效果。
图2. TD904低细胞投入的TSS富集热图
IGV视图结果显示低细胞投入下也能够获得相对应的结果。
图3. TD904低细胞投入的IGV全局视图
图4. TD904低细胞投入的IGV位点视图
2. 小片段富集优势
以293细胞为样本，投入100个细胞，使用H3K4me3抗体，针对插入片段<120 bp进行分析，结果显示，插入片段<120bp的文库能够提供有效数据，TD904能够有效回收小片段，获取对应小片段信息。
图5. 插入片段<120 bp的IGV视图
3. 多组学结果展示
以293细胞为样本，投入100,000个细胞，进行多组学、多靶位点比对探究。结果表明：TD904获得的数据真实可靠，且信噪比较高。
图6. 多组学结果IGV对比
BOX 1： 2 ~ 8℃保存，运输方式根据目的地进行。
BOX 2：-30 ~ -15℃保存，≤0℃运输。
Q1：TD904与TD903的区别是什么？可以混用吗？
A：
1. 区别：
①TD903兼容60-10w起始投入量，TD904兼容10-10w起始投入量；
②TD904采用新升级pA/G转座子与提取磁珠，可特异性回收目的片段，同时有效回收小片段；
③TD904试剂盒包含DNA Spike-in组分，可用于矫正组间差异。
2. TD904全新升级关键组分，不可与TD903混用。
Q2：DNA Spike-in相关问题。
A：DNA Spike-in为非必需添加组分，可根据实际情况选择是否添加。试剂盒中提供的DNA Spike-in 是大肠杆菌λDNA的一段序列，浓度为5 ng/μl，推荐添加量为1 pg/100,000细胞，现用现稀释，可根据样本中目的蛋白丰度以及细胞投入量进行调整。具体的序列信息与分析流程详见说明书。
相关产品
N411-01/02/03
Hyperactive pAG-Tn5 Transposon for CUT&Tag
S614-01/02
TruePrep CUT&Tag Amplification Mix
TD612-01/02
Equalbit 1 × dsDNA HS Assay Kit
EQ121-01/02
