HiScript II 1st Strand cDNA Synthesis Kit
高效的第二代全长cDNA一链合成试剂盒
逆转录;cDNA一链合成;产物可用于PCR;qPCR
· 可靠的逆转录效率:高效的HiScript II Reverse Transcriptase具有较强的温度耐受能力,确保在高温条件下能打开RNA 复杂二级结构,得到更长的cDNA
· 宽泛的的模板起始量:从1 pg-5 μg 总RNA,可扩增片段长达15 kb 以上
· cDNA合成效率高:Anchored Oligo(dT) 23 VN 设计结合位点锚定,特异性高,保证第一链cDNA 合成效率和成功率
· 灵活选择引物: 针对不同实验设计可灵活使用不同类型的逆转录引物
图1.R211可完整逆转录长达20 kb 的RNA 模板
以1 μg HeLa 细胞总RNA 或小鼠骨骼肌细胞总RNA (for Nebulin) 为模板,Oligo(dT) 23 VN为引物进行逆转录。
取1 μl cDNA 为模板,用Vazyme LAmp DNA Polymerase 扩增。
M: DL 15000 Marker。
图2. R211 对qPCR 具有宽广且灵敏的线性逆转录范围
以1 μg-1 pg HeLa 细胞总RNA 为模板做逆转录,使用Random hexamers 和Oligo(dT) 23 VN 共同逆转录,取1 μl cDNA 为模板,分别用AceQ qPCR SYBR Green Master Mix 扩增ACTB 基因和CBR3 基因。
本产品是基于高效的HiScript II Reverse Transcriptase 从总RNA或Poly (A) + mRNA合成一链cDNA的试剂盒,含有一链cDNA合成所需的全部试剂。试剂盒中的HiScript II Reverse Transcriptase具有更高的cDNA合成效率及模板的杂质耐受度,更加适合具有复杂二级结构或低丰度的RNA模板的逆转录。Anchored Oligo (dT) 23 VN设计结合位点锚定,特异性高,保证第一链cDNA合成效率和成功率。特别适用于全长cDNA文库制作、高纯度全长cDNA合成等。合成的一链cDNA 可广泛应用于二链cDNA合成、杂交、PCR法扩增等。
-20℃保存。
Q1:原核生物RNA能用我们的逆转录试剂吗?
A1:可以。原核生物RNA没有polyA尾,所以在逆转录反应体系中需要以Random primer作为逆转录引物。
Q2:延长逆转录时间,是否可以提高逆转录效率?
A2:对于大多数基因,延长逆转录时间对逆转录效率并没有显著提升;对于一些GC含量较高或含高级结构的模板,延长逆转录时间可提升逆转录效率。
Q3:如何评判RNA质量?
A3:RNA质量从两个方面反应:
(1) RNA完整度。通过琼脂糖凝胶电泳验证RNA完整度。以真核生物为例,完整的总RNA有清晰的三条带,分子量从大到小分别为28S、18S、5S,并且28S是18S亮度的两倍;若能看见三条带,但带型模糊或弥散,则说明RNA有部分降解,此时请立即进行逆转录反应,并适量加大模板量;若只能看见分子量很小的一条带或没有条带,则 RNA 已完全降解,需要重新提取。
(2) RNA的纯度。RNA的纯度可以通过OD260/280和OD260/230两个比值是否在1.8-2.1范围内进行判断,蛋白、离子等残留会使比值降低。
Q4:如何选择逆转录的引物?
A4:根据实验的具体情况选择随机引物、Oligo dT或基因特异性引物进行逆转录。
(1) 随机引物:随机结合在RNA的任何区域,适用于rRNA、mRNA、tRNA等所有RNA类型的逆转录反应。
(2) Oligo dT:适用于具有PolyA尾的RNA(原核生物RNA、真核生物的rRNA和tRNA不具有PolyA尾)。 由于Oligo dT结合在PolyA尾上,所以对 RNA 样品的质量要求较高,即使有少量的降解也会使全长cDNA合成量大大减少。
(3) 基因特异性引物:与模板序列互补,适用于序列已知的基因逆转录。
cDNA后续进行PCR扩增长片段,一般用Oligo dT或者基因特异性引物,不建议使用随机引物,因为随机引物是随机结合的,cDNA片段会偏短,可能会对长片段扩增造成稀释,后续扩增不出全长的目的基因;cDNA后续进行qPCR,一般使用Oligo dT和随机引物的混合物,可以避免3’端和5’端的扩增偏好性。
Q5:可以通过测逆转产物cDNA浓度判定逆转效率吗?
A5:不可以,逆转录产物cDNA是混合物,除了cDNA产物以外,还有buffer、逆转录酶、引物,同时还包含未转录的模板RNA,总RNA中的tRNA、rRNA等,都会干扰浓度测定结果,因此不能反应真实的cDNA产量。
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