VAHTS TGS DNA Library Prep Kit for ONT
ONT三代DNA建库试剂盒
ONT TGS快速DNA建库试剂盒
DNA建库;三代建库;TGS建库;Nanopore测序;ONT测序
VAHTS TGS DNA Library Prep Kit for ONT是一款基于连接法的文库构建试剂盒,适用于Nanopore纳米孔测序平台,结合Barcode Adapter可对100 ng - 1.5 μg的gDNA以及扩增子进行单样本或多样本建库。本试剂盒选用定向进化的高催化活性突变体酶,搭配精心优化的缓冲Buffer,可在末端修复/损伤修复/加A尾后无需纯化,直接进行Barcode Ligation,实验流程便捷。试剂盒中提供的所有试剂都经过了严格的质量控制和功能验证,可保证文库构建的稳定性和重复性。
1)操作流程简便: 末端修复+损伤修复+加A尾一管完成,无需纯化,可直接进行Barcode连接
2)建库耗时缩短:全流程建库耗时最短可<2h,较常规流程节省时长≥30min
3)兼容物种多样:可兼容动物、植物、微生物等多物种
4)数据质量优异:长片段读取率高、数据产出高、数据质量好
将人血、水稻、金黄色葡萄球菌的gDNA质控后作为模板,分别通过Vazyme #TS201和友商同类产品构建DNA文库,Nanopore高通量平台测序,比较不同建库试剂的性能。
1)更优的数据产出与质量
2)更高的长片段读取率
如图所示,相比于友商同类产品,Vazyme #TS201具有更优的下机数据产出/质量、更高的长片段读取率。
-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。
Q1:洗脱得率偏低
A1:① 磁珠使用体积少,存在吸取误差。建议Barcode Ligation之后,加入Nuclease-free ddH2O补足至50 μl,吸取20 μl VAHTS DNA Clean Beads (0.4 ×)进行纯化操作;
② 可能由于孵育过程中磁珠聚集下沉所致,可在垂直混匀仪上孵育。但垂直混匀仪的转速不可过高,建议20 - 30 rpm。
Q2: 下机数据量偏低
A2:① 修复时间不足,可适当延长修复时间;
② 连接效率较低,可能由于时间不足所致,建议适当延长连接时间;也可能是Barcode Adapter浓度不足,建议适当增加Barcode Adapter浓度。
Q3: N50和N90长度偏短
A3:① 可能由于模板本身的小片段偏多,或模板打断长度偏短所致;建议建库前进行目的长度片段筛选;
② 可能建库过程中存在剧烈振荡,导致长片段断裂,小片段增多;建议建库时避免涡旋振
荡,可使用移液器轻轻吸打10次以上混匀。
相关产品
Equalbit 1 × dsDNA HS Assay Kit
EQ121-01/02
N411-01/02/03
TS21-01/02
VAHTS BD Ligation Module for ONT
TS22-01/02
VAHTS MP Ligation Module for ONT
TS23-01