ClonExpress Ultra One Step Cloning Kit V3
方便高效的快速克隆试剂盒
快速克隆,高通量克隆,无缝克隆;载体构建,同源重组
ClonExpress技术是一种简单、快速并且高效的DNA无缝克隆技术,利用重组酶可快速将插入片段定向克隆至任意载体的任意位点。本试剂盒采用新优化的2 × CE Mix V3,可以高效兼容1 - 11个DNA片段的同源重组,在保证了大载体、高低GC同源臂等复杂体系的高克隆成功率的同时,进一步显著提升了对DNA投入量的兼容性,减轻了由于DNA片段浓度低导致克隆效率下降的困扰。
高效准确:5 - 30 min完成重组,克隆数多、阳性率高
方便通用:一管式Mix快速加样,实现1 - 11个片段的高通量重组
高灵活性:兼容0.003 - 0.25 pmol的片段投入量、10% - 85%的GC同源臂,以及纯度差或未纯化体系等,减轻实验样本问题带来的困扰
1. 高效准确:克隆数多、阳性率高
(1)测试近30个体系,Vazyme #C117克隆数均优于同类型产品Supplier A、Supplier B和Supplier C。
图1. Vazyme #C117与同类型产品克隆数比对(仅展示部分体系)
(2)测试近30个体系,Vazyme #C117阳性率均在95%以上。
图2. Vazyme #C117阳性率情况(仅展示部分体系)
注:图中碱基数代表阳性克隆菌检条带大小
2.高灵活性:兼容低投入量/低浓度样本
测试不同体系在常规投入量的1/10条件下,Vazyme #C117克隆数和阳性率均显著优于同类型产品Supplier A、Supplier B和Supplier C。
图3. Vazyme #C117与同类型产品克隆数比对(仅展示部分低投*体系)
注:“低投”单片段体系投入量-载体0.003 pmol,片段0.006 pmol;多片段体系投入量-片段/载体各0.003 pmol
-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。
Q1:引物如何设计?
① 引物设计:推荐引物设计软件CE Design,选择相应模块进行设计。
② 引物三部分:同源臂(15 - 20 bp,不计算酶切位点和残留碱基,GC含量40% - 60%) +酶切点(根据实验需求保留或者删除) + 特异性引物(引物Tm值的计算不包括同源臂的序列)。
Q2:平板上未长出克隆或克隆数目很少。
① 引物设计不正确:引物包含15 - 20 bp同源臂(不计算酶切位点),GC含量40% - 60%。
② 线性化克隆载体和插入片段扩增产物的使用量不足/过量,或者比例不佳:尽量按照说明书中推荐的量和比例配制重组反应体系。
③ 载体和插入片段不纯,抑制反应:未纯化DNA使用体积不应超过2 μl(反应体系体积的1/5);建议线性化载体、PCR产物进行凝胶回收纯化,纯化产物溶解在ddH2O中。
④ 感受态细胞效率低:感受态细胞的转化效率需>108 cfu/μg。可进行简单检测,转化0.1 ng质粒,取1/10进行涂板,生长1,000个菌斑,估算转化效率为108 cfu/μg;重组产物的转化体积不应超过感受态细胞体积的1/10,否则会降低转化效率;选择克隆用感受态细胞(如Fast-T1/DH5α),不能选择表达感受态细胞。
Q3:多数克隆不含插入片段或含有不正确的插入片段。
① PCR产物混有非特异扩增产物:优化PCR体系,提高特异性;胶回收PCR产物;鉴定更多的克隆。
② 克隆载体线性化不完全:可通过阴性对照检测载体是否线性化完全,优化酶切体系,提高限制性内切酶使用量、延长酶切反应时间、胶回收纯化酶切产物。
③ 反应体系中混入了相同抗性的质粒:PCR扩增模板为环状质粒时,如扩增产物未纯化直接用于重组反应时推荐Dpn I 消化(推荐SwiftCut Dpn I,Vazyme #C404),或者对扩增产物进行胶回收纯化。
Q4:菌落PCR无条带。
① 引物不正确:推荐使用载体的通用引物进行菌检,或至少使用一条通用引物。
② PCR体系或程序不合适:没有目的条带也没有空质粒条带,建议优化PCR体系、程序;或者提取质粒,以质粒做模板PCR验证;或者进行酶切验证。
③ 重组失败:只有空质粒的条带,说明重组不成功,载体线性化不完全,建议优化酶切体系。
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