2 × Phanta UniFi Master Mix 通用型超高保真酶预混液 (P516)
2 × Phanta UniFi Master Mix(Dye Plus)通用型超高保真酶预混液(蓝色) (P526)
220倍保真度的通用型超高保真酶预混液
* P516/P526仅产品形式不同,产品性能相同
克隆、鉴定、基因合成、NGS
Phanta UniFi DNA Polymerase是基于BioSmart平台精心筛选出的一款新一代高保真DNA聚合酶,兼具高保真度和广泛的Tm值兼容性。 结合新一代热启动技术和适宜的缓冲体系,该产品在特定的通用退火温度下展现出优异的成功率和特异性,能够稳定扩增各种靶标。其保真度是Taq酶的220倍,为分子克隆、测序和定点突变等需要准确扩增的PCR实验提供了高效和便捷的解决方案。2 × Phanta UniFi Master Mix / 2 × Phanta UniFi Master Mix(Dye Plus)是一款预混液,包含Phanta UniFi DNA Polymerase、dNTP和Mg2+等PCR反应组分。只需加入模板和引物,即可进行扩增,从而减少移液步骤,提高检测通量和结果的稳定性。该产品适用于常规模板、粗品以及高GC含量体系(包括引物和模板)。此外,2 × Phanta UniFi Master Mix (Dye Plus)内含电泳指示剂,可在PCR反应完成后直接进行电泳分析。
高保真度:保真度约为Taq酶的220倍
通用程序:一台PCR仪,即可同时扩增多对不同长度/不同Tm值的基因
快速扩增:单重:<10 kb、15 s/kb, ≥10 kb 、30 s/kb;多重:<2 kb、30 s/kb
兼容性广:适用于常规模板、粗品、高AT/高GC及多重体系的扩增
室温稳定:可室温配制,配制好的体系室温放置24 h扩增性能不变
1. 高保真度
采用二代测序方法(P. Mielinis. et al. Journal of Molecular Biology (2021)),测定不同聚合酶的扩增保真度。结果显示, Phanta UniFi DNA Polymerase保真度是Taq DNA Polymerase的220倍。
2.通用程序
使用2 × Phanta UniFi Master Mix(Vazyme #P516,简称P516)/2 × Phanta UniFi Master Mix (Dye Plus)(Vazyme #P526,简称P526)及市售同类高保真酶(Supplier A、Supplier B、Supplier C)进行平行比对。结果显示:P516/P526拥有广泛的Tm值兼容性并优于Supplier A、Supplier B及Supplier C;P516/P526可在一台PCR仪中同时成功扩增多个不同长度/不同Tm值的片段。
3.兼容性广
P516/P526可成功扩增 17.5 kb gDNA,18.2 kb质粒,17.8 kb λDNA,15 kb cDNA;整体GC兼容范围为24%-79%,局部为22%-100%;可兼容大肠杆菌菌液、毕赤酵母菌液、鼠尾裂解液、水稻裂解液及全血等粗品直扩;可兼容2 kb以内的17重扩增;且P516/P526成功率、特异性优于Supplier A、Supplier B及Supplier C。
4.室温稳定
P516/P526可兼容室温配制,反应体系室温配制且室温放置24 h扩增性能不变。
-30~-15℃保存,≤0℃运输
Q1:引物设计原则?
A1:引物长度建议为21 - 25 nt,且引物3'端最后一个碱基最好为G或者C;扩增长片段(≥5 kb)时,引物的长度建议为25 - 35 nt且Tm值应大于62℃。
Q2:使用P516/P526时,可以使用其他PCR酶的反应程序吗?
A2:不同PCR酶适宜的扩增程序不同;为得到理想扩增结果,使用P516/P526时建议使用P516/P526说明书中的反应程序。
Q3:P516/P526退火温度如何设置?
A3:①当上下游引物的Tm值均>50℃,退火温度可使用60℃;②当上下游引物中的一条引物的Tm值≤50℃或两条引物的Tm均≤50℃,退火温度可使用50℃; ③也可按照引物自身Tm值设定退火温度。
Q4:P516/P526扩增速度是多少?
A4:对于单重扩增:长度<10 kb,建议使用15 s/kb; 长度≥10 kb,建议使用30 s/kb;对于多重扩增:建议使用30 s/kb(扩增长度建议< 2 kb)。过度扩增可能会出现拖带或非特异性扩增。
Q5:P516/P526多重扩增时,建议的循环数?
A5:进行多重扩增时,建议使用25个循环,循环数过多可能会影响扩增均一性。
Q6:扩增时产生突变的原因及建议?
A6:可以从以下几点来分析:
(1)模板本身存在突变
检查模板,若模板是质粒,建议送质粒去测序;若模板是cDNA,建议重复实验,如果仍有突变,可能是cDNA有问题,建议重新制备cDNA,制备cDNA前检测RNA的完整度及纯度。
(2) 模板长时间在紫外光下照射,引入突变
切胶回收过程中避免长时间在紫外光下照射。
(3) 基因序列与NCBI上的不一致
建议再重复一次送去测序,若结果和上一次一样,说明序列可能和NCBI上的不一致。
(4) 少量序列存在非严谨序列
有相似重组序列,导致重组错位。
Q7:扩增效率低,实验组无扩增条带。
A7:(1) 引物
检查人工合成的引物是否因存储条件不当而降解;引物设计是否合理,可利用BLAST检查引物特异性或重新设计引物。
(2) 模板
长期放置、反复冻融会导致模板断裂、开环或降解,应使用新鲜制备的DNA双链作为模板;模板为粗品,存在抑制物,建议降低模板浓度;若模板为cDNA,要确认逆转录所用RNA的纯度及完整度。
(3) 酶
反应所用的酶失活,建议更换新酶或用另一来源的酶重新实验。
(4) 扩增体系
反应体系配制错误,建议重复实验。
(5) 反应程序
检查变性温度是否准确,PCR仪指示温度与实际温度是否相符,如果温度过高,酶在前几个循环就迅速失活,温度过低则模板变性不彻底;退火温度不合适,可对退火温度设置梯度,摸索合适的退火温度;检查延伸时间是否充足。
Q8:扩增的条带亮度不太亮。
A8:(1) 引物
检查人工合成的引物是否降解。
(2) 模板
首先确认模板的质量,长期放置、反复冻融会导致模板断裂、开环或降解,应使用新鲜制备的DNA双链作为模板;如果模板没有了,可用首次扩增产物按倍比稀释后作为模板进行二次扩增。
(3) 反应程序
可梯度摸索适宜退火温度;延长延伸时间,提高循环数。
Q9:扩增特异性差,非特异性扩增。
A9:(1) 引物
引物设计不够优化。引物与靶序列有非特异性互补或自身聚合成二聚体,可降低引物浓度进行优化,必要时重新设计引物。
(2) 模板
模板不纯,被污染,需重新制备模板。
模板降解或过量,通过电泳检查模板完整性及浓度,必要时重新纯化模板。模板的使用量请参考说明书。
(3) 反应程序
反应程序不够优化。如果出现比目的条带小的杂带,可通过提高退火温度,降低循环数调整;如果出现比目的条带大的杂带,可缩短延伸时间、降低循环数。
Q10:扩增产物跑胶条带弥散或拖尾。
A10:(1) 胶
制胶时要使胶完全融化。
(2) 引物
检查引物是否降解。
(3) 模板
模板降解或过量,可通过电泳检查模板完整性及浓度,必要时重新制备模板。模板的使用量请参考说明书。如果目的条带较长,模板是cDNA,要确认逆转录所用RNA的纯度及完整度,逆转录时不加随机引物重新逆转录。
(4) 反应程序
反应程序不够优化。退火温度不合适,可对退火温度设置梯度,摸索合适的退火温度。
Q11:空白对照出现扩增产物。
A11:(1) 引物设计不合理
扩增序列与非目的扩增序列有同源性,PCR也可以扩增出非靶序列的序列。
(2) 若扩增产物条带大小与目的条带一致,说明有污染
更换新的Mix、水或引物重复实验。反应体系在超净工作台内配制,减少气溶胶污染。
(3) 为了避免靶序列受到整个基因组或大片段的交叉污染,操作时应小心轻柔,防止将靶序列吸入加样枪内或溅出离心管外。
(4) 为了避免靶基因受到空气中小片段核酸污染,可用巢式PCR方法减轻或消除污染。
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