VAMNE Magnetic Pathogen DNA/RNA Kit(Prepackaged)
不再繁复,自动化实现病原微生物DNA/RNA共提取
PCR、Real-Time PCR、宏基因组文库构建、DNA/RNA共建库等
· 兼容:兼容血清、血浆、肺泡灌洗液、痰液和拭子等临床生物液体样本
· 共提:同时提取病原微生物的DNA和RNA
· 快速:高通量且1 h内可完成所有流程
· 洁净:严格把控背景菌污染
本试剂盒适用于从生物液体样本(肺泡灌洗液、痰液、脑脊液、拭子液、血清、血浆等)中分离纯化DNA和RNA。试剂盒采用化学法与机械法相结合的裂解方法,能够高效裂解细胞壁较厚的细菌或真菌类样本。本试剂盒中使用的高亲和力硅基磁珠,可在高盐缓冲液作用下,通过氢键和静电吸附核酸,经过漂洗去除多余的蛋白质和盐;在低盐洗脱液或Nuclease-free ddH2O作用下,磁珠释放核酸,从而达到快速分离纯化核酸的目的。本试剂盒匹配的全自动核酸提取仪(Vazyme #VNP-32P)利用磁珠吸附原理,通过特制的磁棒吸附、转移和释放磁珠,实现磁珠/核酸的转移,自动完成核酸的提取和纯化。本试剂盒分离的DNA和RNA适用于多种下游应用,包括PCR、Real-Time PCR、宏基因组文库构建、DNA/RNA共建库等。
1. 高检出
分别在不同样本类型中掺入103 CFU的细菌、真菌和滴度为10 TCID50 的PRV、200 TCID50 的PRRSV,参照Vazyme #RM602、Vazyme #RM603、Supplier A和Supplier B同类产品的实验流程进行微生物核酸提取,使用qPCR法对提取得到的微生物核酸进行定量,检测的平均Ct值越低,表示检出率越高。结果表明:Vazyme #RM602和Vazyme #RM603对不同样本中不同微生物的检出效果优于Supplier A和Supplier B同类产品。
图1. 提取产物qPCR定量结果
在一定量的HEK293细胞中掺入不同起始量的病原,参照Vazyme #RM602、Vazyme #RM603、Supplier A和Supplier B同类产品的实验流程进行微生物核酸提取。随后对提取产物中病原微生物含量进行mNGS、tNGS检测。结果表明Vazyme #RM602和Vazyme #RM603对不同种类病原微生物的检出Reads数均优于Supplier A和Supplier B同类产品。
图2. 不同微生物检出Reads数-mNGS
图3. 不同微生物检出Reads数-tNGS
2. 高回收率
在400 μl人血浆样本中分别掺入200 ng DNA小片段(70 bp)和200 ng RNA小片段(107 nt),参照Vazyme #RM602、Vazyme #RM603的实验流程进行微生物核酸提取,通过Qubit计算游离核酸回收率。结果表明Vazyme #RM602和Vazyme #RM603在血浆样本上均有良好的游离核酸提取效率。
15 ~ 25℃保存,室温运输
1. RM602能提全血吗?
A:可以。
2、RM602能兼容组织样本吗?
A:未测试,理论上如果是研磨后的组织样本,是可以兼容的。
3、RM602/RM603试剂组分一样吗?
A:不一样。
4、其他的核酸提取仪只要加热槽同类型就能够适配RM602吗?
A:程序可能需做相应调试。
5、我们如何防交叉污染?
A:1、耗材设计:2 ml深孔板加样体积不超过1.2 ml;2、提取前:75%乙醇擦拭仪器,紫外照射30min;3、样本前处理后转移上清时,加样应将枪头伸入液面下方加样。
6、所用磁珠修饰基团是什么?
A:硅羟基。
7、共提全流程如何防止RNA降解?
A:1、试剂耗材经过工艺处理,无菌无酶;2、提取前:75%乙醇擦拭仪器,紫外照射30min;3、裂解结合Buffer中的盐组分能够抑制RNA酶的活性。
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